Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms