Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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