Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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