Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd300ldQ8VCH2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms