Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BbxQ8VBW5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BbxQ8VBW5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms