Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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