Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms