Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms