Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma3Q8JZW8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms