Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms