Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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