Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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