Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms