Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc27Q8CD92 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc27Q8CD92 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc27Q8CD92 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ttc27Q8CD92 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms