Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms