Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms