Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms