Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Phtf2Q8CB19 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Phtf2Q8CB19 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Phtf2Q8CB19 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Phtf2Q8CB19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Phtf2Q8CB19 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf2Q8CB19 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms