Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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