Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc15Q8C9M2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms