Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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