Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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