Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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