Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms