Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYY4

Ttc39b, Tetratricopeptide repeat protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39bQ8BYY4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms