Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM1

Hbq1a, Globin d2, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1aQ8BYM1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hbq1aQ8BYM1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms