Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms