Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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