Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms