Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp9Q8BTS3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp9Q8BTS3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp9Q8BTS3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp9Q8BTS3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp9Q8BTS3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp9Q8BTS3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms