Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Fbxo38Q8BMI0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo38Q8BMI0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms