Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms