Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim6Q8BGE7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim6Q8BGE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms