Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms