Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim65Q8BFW4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms