Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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