Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrfn4Q80XU8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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