Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms