Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms