Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms