Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms