Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms