Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms