Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc44a1Q6X893 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms