Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms