Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.7 ms