Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms