Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms