Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms