Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms